הפרשה המרכזית שבה חשוד בנימין נתניהו, המכונה פרשת 2000, נוגעת לאיש עסקים ישראלי שניסה לגייס את ראש הממשלה הישראלי כדי שיפעל למענו, ובתמורה הוא יטיב עם ראש הממשלה. לפי הפרסומים בכלי התקשורת הישראליים, הפרשה כוללת תיעוד ל"חיבור בוטה ויוצא דופן בין הון ושלטון".

כמו כן,דווח כי אותו איש עסקים מוכר ניסה לשכנע את נתניהו לקבל החלטה מסוימת, אך לא ברור האם ראש הממשלה הישראלי אכן קיבל את ההחלטה. לגבי זהותו של איש העסקים דווח כי במענה לשאלותיו, נמסר שלא מדובר בשאול אלוביץ', הבעלים של חברת בזק, ולא ביצחק תשובה, בעל קבוצת דלק.

בנוסף פורסמו בחדשות של ישראל פרטים נוספים על הקשר שבין נתניהו לאיש העסקים ארנון מילצ'ן. באחרונה פורסם בעיתון "הארץ" כי מילצ'ן הוא דמות מרכזית בפרשה הראשונה שבגינה נחקר נתניהו, ושבמסגרתה על פי החשד קיבל ראש הממשלה טובות הנאה בשווי מאות אלפי שקלים מאנשי עסקים, בהן סיגרים ומשקאות חריפים. לפי הדיווח, בשנת 2014 שוחח ראש הממשלה נתניהו שלוש פעמים בטלפון עם שר החוץ של ארה"ב ג'ון קרי כדי לסייע למילצ'ן לקבל ויזה לארה"ב ל-10 שנים. עוד דווח כי ככל הנראה, בעקבות התערבותו של ראש הממשלה, בעיית הוויזה של מילצ'ן נפתרה.

מוקדם יותר התייחס פרקליטו של נתניהו, עו"ד יעקב וינרוט, לחשדות נגדו ואמר כי אין איסור על אנשי ציבור לקבל סיגרים במתנה מחברים. וינרוט לא הכחיש שנתניהו קיבל במתנה את הסיגרים אך טען כי אין בכך "בדל של עבירה פלילית".

ביום (חמישי),נתניהו נחקר במשך חמש שעות במעונו הרשמי בנוגע לפרשה החמורה יותר מבין השתיים שבהן הוא חשוד. מהמשטרה נמסר כי ביומיים האחרונים נחקר גם חשוד נוסף וכן כי לא ניתן למסור פרטים נוספים בשל החשש מפני שיבוש חקירה.

במשטרת ישראל ציינו בהודעתם כי קיים חשש לשיבוש החקירה על ידי החשודים בפרשה השנייה שנחקרת ורק באחרונה הובאה לידיעת ראש הממשלה. חוקרי המשטרה הבהירו לנתניהו בסיום החקירה כי שיחה עם מי מהמעורבים בנושא תוכן החקירה עשויה להוביל לשיבושה.